政府部门之间的关系主要包括以下几种：
领导关系
上下级人民政府之间存在领导与被领导的关系。上级政府有权对下级政府下达指示或命令，下级政府必须遵从。
指导关系
上下级政府主管同一类业务的职能机构之间存在指导关系。上级机构有权就某一方面的业务作出政策性的指示，但下级机构有权根据自己的情况决定是否遵从及遵从的程度。
协调关系
本级政府的不同机构之间存在协调关系。协调机构有权就某些政策问题或具体事项作出决定，并对有关部门有一定的约束力。
业务关系
互不统属的政府机构之间存在业务关系。某一政府机构在其职权范围内发布的管理规定，其他政府机构有遵从的义务。
协作关系
政府机构之间为了共同的目标或任务而进行的合作。
监督关系
上下级人民法院之间存在监督与被监督的关系。
上下级人民检察院之间存在领导与被领导的关系。
法律上的监督关系
上下级人民代表专大会之间存在法律上的监督属关系和工作上的联系与指导关系。
这些关系构成了政府内部和外部复杂的网络，确保政府各部门能够高效协同工作，实现国家治理的目标。
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