机械设备租赁公司的税率如下：
一般纳税人
增值税税率为13%。
小规模纳税人
增值税征收率为3%。
此外，根据《财政部国家税务总局关于明确金融房地产开发教育辅助服务等增值税政策的通知》（财税（2016）140号），对于带人的机械设备租赁服务，一般纳税人适用的增值税税率为9%。
建议：
机械设备租赁公司在开具增值税发票时，应根据自身是否为一般纳税人选择相应的税率。
对于一般纳税人提供的带人机械设备租赁服务，需特别注意按照9%的税率开具发票。
小规模纳税人应始终按照3%的征收率缴纳增值税。
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